数学与应用数学专业设基础数学和金融信息技术两个专业方向。基础数学方向培养能从事数学基础理论研究的优秀人才。每年从全国高中数学竞赛的优胜者中录取30名保送生组成基地班，由数学系与南开数学所共同培养。该班聘请优秀教师授课，教学起点高、科目新，为学生尽早接触数学前沿学科创造了有利条件。毕业时多数学生被保送或经考试成为硕士研究生或直接攻读博士学位研究生。该专业开设的基础课和专业课有:数学分析、高等代数与解析几何、计算机基础与C语言、Fortran语言、数学软件、偏微分方程、实变函数、复变函数、泛函分析、概率论、代数拓扑、微分几何、计算机代数、广义函数、微分拓扑、李群李代数、现代微分几何等。金融信息技术方向的培养目标是使学生在扎实的数学、计算机技术和金融经济学基础上掌握各种金融信息分析方法、金融决策技术、金融计算机网络技术及其有关软件，熟悉各种金融产品、金融市场和金融工程，能在金融机构及相关领域从事高新技术工作或成为金融研究的高新技术专业人才。基础课包括数学分析、高等代数、概率统计、计算机基础、软件语言和程序设计、宏观和微观经济学、数值方法、计量经济学等。专业课程包括证券投资分析、金融市场预测、金融运筹决策技术、保险精算学、数理金融学、金融信息系统、金融分析应用软件、货币银行学、金融工程学等。