文章指出，改革开放初期，由于我们采取的是渐进式的制度变迁来推进改革，因此改革的阻力相对比较小。但是上世纪90年代中期以来，中国几乎所有的改革都由政府主导和推动，政府主导往往就是部门主导，比如国企、医疗、教育、投资、金融、证券、住房、劳动和社会保障以及事业单位改革、社会管理体制改革等等，现阶段暴露出的政企不分、政事不分、政府与社会中介组织不分，其主要矛盾也都在部门主导。

    文章说，部门利益越来越多地体现在改革政策的提出和制定上，势必造成既有利益集团对于改革的深化采取抵制态度。像有的学者所说，目前的改革已经进入“利益博弈时代”，需要“重建改革共识”。

    “十一五”规划明确了“必须紧紧抓住机遇，应对各种挑战，认真解决长期积累的突出矛盾和问题，突破发展的瓶颈制约和体制障碍，开创社会主义经济建设、政治建设、文化建设、社会建设的新局面，为后十年顺利发展打下坚实基础”的改革方向定位。

    文章强调指出，可以说，改革的着力点要转向如何实现政府职能的转变，充分发挥政府组成部门在市场监管、社会管理和公共服务中的作用；同时又要保证行政部门权力的中立化、公正性，控制权力部门化。这是未来改革中不得不面对的问题，关系到改革能否继续深化，最后能否成功的大问题。